بخشی از پاورپوینت
اسلاید 1 :
آموزش نرم افزار GenALEx
اسلاید 2 :
معرفی
تجزیه و تحلیل داده های نشانگرهای مولکولی (RAPD, SSR, AFLP,..) و مورفولوژیکی
مقایسات بین جمعیتی و درون گونه ای
سیستم صفر و یک (1 یا 0) برای صفات و آلل هایی که رابطه غالب و مغلوبی دارند. ( رپید)
سیستم حروف برای آلل ها و صفاتی که رابطه هم بارزی دارند.
مثال :
حرف a در مورد هر پرایمر (لوکوس) یعنی فرد مورد نظر آلل a را دارد و حرف ab یعنی فرد هم بارز مورد نظر دارای آلل ab است.
اسلاید 3 :
نصب و اجرا
http://biology-assets.anu.edu.au/GenAlEx/Welcome.html
اسلاید 8 :
Distance :فاصله ژنتیکی
Amova:تجزیه واریانس مولکولی
Mantel: مقایسه دو ماتریس
PCoA: تجزیه به مولفه های اصلی
Spatial: گروه بندی بر اساس اطلاعات جغرافیایی
اسلاید 9 :
Frequency: توصیف مکان ژنی
HWE: تعادل هاردی واینبرگ
اسلاید 10 :
Shannon: شاخص شانون
Relatedness: بررسی ارتباط افراد
Multilocus: نشانگرهای چند مکان ژنی مثل رپید
Assignment: انتساب افراد به داخل گروه بندی
اسلاید 11 :
نحوه وارد کردن داده ها
مهمترین نکته رعایت فرمت هست.
اسلاید 12 :
تعداد لوکوس
تعداد نمونه ها
تعداد جمعیت ها
تعداد افراد هر جمعیت
dominant
اسلاید 13 :
تجزیه فراوانی و برآورد شاخص های تنوع
اسلاید 15 :
فراوانی آلل ها
تعداد آلل های مشاهده شده
تعداد آلل های موثر
شاخص شانون و نی
میانگین کل جمعیت ها
درصد چند شکلی
فرمول ها
اسلاید 16 :
فاصله ژنتیکی
اسلاید 18 :
تجزیه به مولفه های اصلی
اسلاید 20 :
با تشکر از توجه شما
