بخشی از پاورپوینت
اسلاید 1 :
شناسایی، طبقهبندی و بررسی بیان In Silico خانواده ژنی پلیآمین اکسیداز در سه گیاه انگل مدل از تیره گل جالیز
اسلاید 2 :
مقدمه و اهداف
گیاهان انگل هرساله باعث ایجاد خسارت های زیادی در محصولات کشاورزی می شوند.
پلی آمین اکسیدازها (PAOs) با تنظیم متابولیسم پلی آمین ها و گونه های واکنش گر اکسیژن (ROS) نقش مهمی در فرایندهای زیستی در گیاهان دارند.
این مطالعه با هدف بررسی نقش احتمالی پلی آمین اکسیدازها در مراحل مختلف نمو سه گیاه انگل Orobanche aegyptiaca، Striga hermonthica و Triphysaria versicolor انجام گرفت.
اسلاید 3 :
مواد و روش ها
شناسایی ژن های پلی آمین اکسیداز در گیاهان انگل
13 توالی پروتئین ارتولوگ PAO از گیاهان اربیدوپسیس، برنج، ذرت و پنبه که قبلا شناسایی شده اند انتخاب و برعلیه ژنوم سه گیاه انگل در سایت PPGP BLASTP (http://ppgp.huck.psu.edu/) انجام شد (E-Value: 1e-10).
شناسایی دومین آمین اکسیداز و تأیید توالی ها
از سایت pfam به آدرس (https://pfam.xfam.org/) و الگوریتمHMMER و تکنیک PSI-BLAST استفاده شد.
تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک
با استفاده از الگوریتم Clustalw در نرم افزارMEGA7 انجام شد.
بررسی پروفایل بیانی ژن های پلی آمین اکسیداز در مراحل مختلف رشدی گیاهان انگل
پلات وولکانو و هیت مپ بیانی ژنها در مراحل محتلف سه گیاه انگل با استفاده از نرم افزارR3.6.1 رسم گردید.
آئروسول
اسلاید 4 :
نتایج و بحث
در مجموع هشت ژن پلی آمین اکسیداز در سه گیاه مورد نظر شناسایی شد.
اسلاید 5 :
درخت فیلوژنی پروتئین های پلی آمین اکسیداز در سه گیاه انگل
اسلاید 6 :
پلات وولکانو از بیان ژن ها در دوره رشدی سه گیاه انگل
ژن هایStHeBC3_19622.1 و StHeBC3_5232.9 در گیاه S. hermonthica در طول مراحل رشدی این گیاه تغییر بیان معنی داری داشته اند،
اسلاید 7 :
هیت مپ بیان ژن ها از مرحله جوانه زنی تا گلدهی در سه گیاه انگل
دو ژن StHeBC3_19622.1 و StHeBC3_5232.9 در مرحله میانکنش S. hermonthica با گیاه میزبان بیشترین بیان را دارند.
اسلاید 8 :
نتیجه گیری
در بین ارتولوگ های مورد بررسی در گیاهان انگل، دو ژن پلی آمین اکسیداز در گیاه S. hermonthica در مرحله میانکنش
این گیاه با گیاه میزبان بیشترین سطح بیان را داشتند و احتمالا نقش مهمی را در این فرایند ایفا می کنند.
نتایج آنالیز In Silico می تواند از طریق آزمایشات مولکولی مورد تأیید قرار گیرد و مقدمه ای برای مطالعات بیشتر در جهت بررسی نقش پلی آمین اکسیدازها در فرایند پارازیتیسم گیاهان انگل باشد.
